南京市秦淮医院始建于1950年，是一所二级综合医院。医院现有职工240人，其中卫技人员1%人，副高职称以上17人。医院临床科室15个，医技科室7个，特色专科门诊9个，病区3个，病床152张。
产科被南京市卫生局列为重点专科，负责早孕建卡、孕期保健、正常接产以及各种难产处理和产后保健服务等。妇科开展各种疑难杂病的治疗，血液净化(透析)治疗中心始建于1989年，十多年来，治疗了众多尿毒症、肾功能衰竭病人，1998年被南京市总工会推出为“血透扶贫’’工程，目前，医院已成为南京市职工扶贫血透中心、南京市总工会慈善医疗门诊部。为特困企业职工和下岗职工中需做血液透析的病人减免25%的医疗费用。    特色专科开展了糖尿病血管病变、肿瘤、心脑血管病变、神经系统疾病、乳腺病、ok镜近视矫正、疼痛治疗等。